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 Réunion du printemps

Inscrivez-vous à http://meetup.com/monbug, ou en envoyant un courriel à inscription@monbug.ca
La prochaine réunion aura lieu le mercredi 14 mars, de 17:00 à 18:45 dans la salle André-Barbeau de l’IRCM.

MonBUG est de retour, avec l’arrivée du printemps!
Cette réunion porte entièrement sur l’utilisation de R dans les analyses bio-informatiques.

Mathieu Lajoie, PhD, nous présentera comment il utilise R dans ses analyses génétiques. Selin Jessa, auteur du package R, chromswitch, nous expliquera les étapes pour soumettre son propre package à Bioconductor, le « dépôt » pour les « packages » bio-informatiques.

Agenda17:00 – 17:05 Introduction et annonces communautaires
17:05 -17:45 « Getting reliable estimates of tumour purity to improve downstream analyses », Mathieu Lajoie, PhD, Watson lab
17:40 – 18:05 Pause, avec collations et rafraîchissements.
18:05 – 18:45 An introduction to Bioconductor package development, Selin Jessa, Kleinman lab

Résumé de la présentation de Mathieu (en anglais)
« Getting reliable estimates of tumour purity to improve downstream analyses. Solid tumour samples are usually contaminated with a highly variable fraction of infiltrating lymphocytes and stromal cells.In this presentation I will describe different approaches to estimate the cancer cell fraction and discuss how this can impact RNAseq and copy number analysis, using TCGA data. R code snippets included. »

Nous sommes toujours à la recherche de présentateurs enthousiastes. MonBUG est un forum informel, où les bio-informaticiens peuvent partager leur recherche, alors n’hésitez pas à vous porter volontaire pour une présentation.
Aussi, si vous cherchez un emploi, ou si vous offrez un emploi, c’est un excellent endroit pour faire du réseautage. On peut même vous laisser le plancher libre au début de la réunion pour vous vendre si vous voulez.