Ingénieur en bioinformatique 1

Institution / Département:
Laboratoire du Dr. Benjamin Haibe-Kains
Institut de recherches cliniques de Montréal

Sommaire des responsabilités
Le candidat assumera la mise en place et la gestion du plateau de bioinformatique, le développement de processus automatiques pour analyser des données génomiques à haute densité et l’implémentation de méthodes bioinformatiques mises au point à l’Institut. Le candidat travaillera en collaboration avec les membres de l’unité de recherche en bioinformatique et génomique computationnelle ainsi qu’avec les autres chercheurs à l’IRCM et les collaborateurs externes dans le but de définir les besoins des usagers, tant sur le plan technique qu’analytique, de générer des rapports d’analyse et d’évaluer et superviser la performance des processus d’analyse sur le(s) superordinateur(s) du plateau de bioinformatique. En plus de ces responsabilités, le candidat travaillera directement avec les usagers pour la collecte, la gestion, l’interprétation et l’analyse des données biologiques et/ou cliniques, avec une emphase particulière sur l’analyse de données de séquençage à très haut débit. La personne partagera son temps entre le plateau et l’unité de recherche en bioinformatique et génomique computationnelle dirigée par le professeur Benjamin Haibe-Kains, afin de développer de nouveaux outils bioinformatiques.

Qualifications requises:

  • Doctorat ou maitrise en bioinformatique, informatique, sciences de la vie ou domaines associés avec un minimum de 3 à 5 ans d’expérience, plus spécifiquement :
    • Expertise avec plusieurs bases de données biologiques, incluant, mais non limité à, GenBank, EnsEMBL, UCSC Genome Browser, Reactome et autres ressources similaires.
    • Connaissance approfondie et compétences reconnues en technologies génomiques et leurs applications, incluant les données de séquençage à très haut débit.
    • Excellente connaissance en programmation avec Perl/Python/Java/C++, programmation statistique en R ou outils similaires, bases de données SQL et aptitude à concevoir et implanter des logiciels d’analyse et en développement web.
    • Connaissance des concepts et procédures standards pour le développement de logiciels.
    • Expérience avec les environnements Unix et Windows.
  • Aptitude à travailler dans un environnement dynamique et à assumer un rôle de leadership.
  • Capacité d’organiser, de résoudre des problèmes et de travailler à la fois de manière indépendante et en collaboration, tout en respectant les échéanciers.
  • Habiletés de communication interpersonnelle
  • Excellente maîtrise de l’anglais; connaissance du français serait un atout.

Conditions de travail
Poste à temps plein, contrat d’une durée de deux (2) ans (renouvelable). L’IRCM offre une gamme concurrentielle d’avantages sociaux.

Comment postuler
Faire parvenir votre c.v. ainsi que votre lettre de motivation au plus tard le 26 février 2012 en précisant le concours : Ingénieur en bioinformatique 1 à : benjamin.haibe.kains@ircm.qc.ca ou par courrier :

Dr Benjamin Haibe-Kains
Institut de recherches cliniques de Montréal
110, avenue des Pins Ouest
Montréal (Québec) H2W 1R7

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