Nous sommes très heureux d’annoncer la date de notre premier meeting de 2021! Le meeting sera virtuel, avec deux courtes présentations.
Joignez-vous à nous le mercredi, 10 février, à 16h30 pour en apprendre davantage sur deux sujets bioinfos qui promettent d’être très intéressants. Vous aurez le plaisir d’entendre
– 16:30 Zineb Mohssine, Analyse métagénomique du microbiome de l’écosystème marin
– 17:30 Assya Trofimov, Factorized embeddings learns rich and biologically meaningful embedding spaces using factorized tensor decomposition
La métagénomique est une branche de bio-informatique qui permet d’étudier la diversité des organismes qui ne sont pas détectables au microscope ou non culturables. Zineb nous parlera de l’historique de la métagénomique, de la diversité de l’écosystème marin et des techniques utilisées pour générer des informations sur la composition et la diversité des échantillons d’eau.
Assya s’intéresse à l’apprentissage de représentations pour la génomique. Elle nous parlera de l’algorithme d’apprentissage profond de réduction de dimensionnalité qu’elle a développé (référence plus bas). Appliqués aux données de RNA-Seq, les factorized embeddings peuvent être vus comme une version compressée des données, mais une version qui conserve l’information biologique pertinente liée aux gènes et aux échantillons.
Nous allons utiliser jitsi pour la rencontre (voir le lien sur la page Meetup).
L’événement sera aussi retransmis sur YouTube Live : https://youtu.be/ktUhlwBLfVw
Vous pouvez vous enregistrer pour le meeting sur Meetup ou en envoyant un courriel à info@monbug.ca. Et n’oubliez pas de nous contacter via Meetup ou par courriel si vous aimeriez présenter lors d’une future rencontre. Nous sommes toujours à la recherche de présentateurs enthousiastes.
[Ajouter au calendrier Google]
Trofimov et al., Factorized embeddings learns rich and biologically meaningful embedding spaces using factorized tensor decomposition, Bioinformatics, July 2020, Pages i417–i426, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa488