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Joignez-vous à nous virtuellement, mercredi le 14 avril à 16h30 pour en apprendre davantage sur deux sujets bioinfo très intéressants. Vous aurez le plaisir d’entendre :

• 16:30, Mathieu Bourgey, titre à venir
• 17:10, Maria Virginia Ruiz Cuevas, Most Non-canonical Proteins Uniquely Populate the Proteome or Immunopeptidome

Mathieu, responsable de la bio-informatique au Canadian Centre for Computational Genomics (C3G), fera un survol des aspects techniques liés à l’analyse de données de séquençage de cellules uniques (single cell sequencing).

Maria Virginia présentera comment elle utilise des données de séquençage pour identifier, caractériser et quantifier les protéines non canoniques trouvées dans les cellules cancéreuses. Ces protéines aux caractéristiques distinctes pourraient jouer un rôle crucial dans l’immunosurveillance des tumeurs.

Nous allons utiliser jitsi pour la rencontre (voir le lien sur la page Meetup).  L’événement sera aussi retransmis sur YouTube Live : https://youtu.be/Gqcut5NGpF0

Vous pouvez vous enregistrer pour le meeting sur Meetup ou en envoyant un courriel à info@monbug.ca.  Et n’oubliez pas de nous contacter via Meetup ou par courriel si vous aimeriez présenter lors d’une future rencontre.  Nous sommes toujours à la recherche de présentateurs enthousiastes.

* Voici le résumé de la présentation de Maria Virginia :

Most Non-canonical Proteins Uniquely Populate the Proteome or Immunopeptidome.   Significant evidence demonstrates the presence of unusual non-canonical proteins in cancer cells that appear to possess properties distinct from those of canonical proteins, making them important sources for the development of immunotherapies. Indeed, the immune system collects information about the health status of cells by reading protein fragments exposed on the cell surface. These fragments allow T cells to detect and eliminate cancer cells by reacting to the presence of unusual fragments. Because of their central role in cancer elimination, the identification of cancer-specific fragments is crucial for the design of vaccines that effectively stimulate the patient’s own immune system to fight the disease. My research therefore aims to elucidate the hitherto elusive rules of biogenesis of non-canonical proteins in cancer cells. To do so, I develop and use computational strategies to study sequencing data to identify, characterize and quantify these unusual proteins. This will provide novel information on the cellular processes of protein synthesis and folding in normal and cancer cells, and thus allow us to identify with high confidence cancer-specific actionable fragments that can be tested in therapeutic vaccines. 10.1016/j.celrep.2021.108815